ナツメはいわゆる「半陰陽」であり、性自認も男女どちらでもない。本来であれば第二次性徴が来る前にどちらかの性で生きるかを決めるはずが、ナツメはどちらにするとも決めず、第二次性徴がなぜか来ないまま高校生になってしまった。ナツメ自身は性別を確定させる必要は無いと言い、両性具有状態のまま生きているが、周囲に自分の身体に関する事を知られ、嫌な目に合うことを過剰に恐怖している。両性具有状態のせいで体調を崩すことが多かったことが長期入院の理由である。
UGNに保護された際には、説明のため偶然同席していたローザ・パスカヴィルに身体のことを感づかれ、散々拒否した末に二人だけの秘密にする前提で詳細を話した。その関係で賢者の石適合前からアールラボに出入りしていたが、賢者の石適合後は珍しすぎる被験体という扱いに変化しているためナツメはちょっと鬱屈している。
ちなみに実は双子ではなく三つ子であり、ナツメ以外の二人は男女一人ずつに分かれて生まれてきた。（ナナセという名前はどちらかに実際に付けられた名前らしい）だが生まれた直後に物珍しがりな両家の祖父母が勝手にナツメ以外の二人を養子に出してしまった。ナツメの両親は信頼していた自分たちの両親がとんでもない所行をしでかしたことに激怒し、養子に出された二人に会わせろと迫ったが情報を全て遮断され自分たちで探すことすら妨害されたため、泣く泣くナツメを愛情深く育てた。嘘で覆い隠した真実をナツメに伝えたのは祖父母に対する反抗の表れであったが、当のナツメは情報不足故に祖父母にその事を詰め寄ることすらしていないのが現状である。